我国首个以牧草为主的多组学数据库平台建树
美洲狼尾草。国首个牧
本报讯(记者张晴丹)四川农业大学牧草育种团队开拓了一个收费 、多组易操作、学数数据周全 、据库建树功能多样的平台以狼尾草为主的多组学数据库平台(Milletdb) ,这是国首个牧我国首个以牧草为主的多组学数据库。8月3日,多组相关论文宣告于《植物生物技术》。学数
美洲狼尾草一类的据库建树小米(millets)是抗非生物胁迫能耐强、营养丰硕的平台禾本科优异牧草及细粮 。它可保障极其天气条件地域的国首个牧人类食粮清静 ,并为其余作物提供与耐非生物胁迫无关的多组遗传资源。随着组学技术的学数快捷睁开,相关数据量激增,据库建树但对于大部份科研使命者而言 ,平台运用数据快捷开掘基因仍是挑战。当初尚未一个周全、零星的相关多组学数据合成平台 ,这严正拦阻了紧张候选基因的开掘以及份子育种历程 。
Milletdb搜罗millets7个属的基因组以及1800份差距的组学数据,搜罗图形泛基因组学、基因组学 、转录组学、表不雅基因组学、变异组学以及表型组学等数据 。Milletdb集成为了20种适用工具 ,可能辅助用户从同源搜查 、序列BLAST、性状等多角度快捷识别单个基因,从多个层面构建调控收集并表征基因集 ,可快捷查找候选基因及其相关信息。
相关论文信息:https://doi.org/10.1111/pbi.14136
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